典型應(yīng)用領(lǐng)域介紹
廣泛應(yīng)用于:分子標(biāo)記輔助育種、基因組學(xué)、系統(tǒng)生物學(xué)和分子進(jìn)化、轉(zhuǎn)基因研究等生物化學(xué)研究領(lǐng)域植物組織核酸提取。
分離完整種子中的核酸,需先用機(jī)械方法破碎種子,再提取和純化核酸。通常的機(jī)械破碎方法速度很慢而且易導(dǎo)致交叉污染,不適合高通量的種子破碎。
用GENO 對(duì)微孔板中的種子進(jìn)行研磨,可從種子細(xì)胞中快速釋放出大量核酸;再?gòu)膭驖{液中分離純化出核酸。例如:用水浸泡過(guò)夜大豆,3 分鐘內(nèi)被均質(zhì)化成漿液,用于DNA 分析的材料來(lái)源。
從培養(yǎng)細(xì)胞中快速提取基因組D N A為P C R 分析做準(zhǔn)備
PCR 技術(shù)提高了核酸檢測(cè)和定量測(cè)序效率。但在模板擴(kuò)增前需要一個(gè)包括細(xì)胞收集和核酸溶解純化的步驟,過(guò)程緩慢。然后用層析樹脂把核酸從裂解液中分離出來(lái)。需要耗費(fèi)大量時(shí)間和昂貴的材料。
GENO 技術(shù)快速破碎大量培養(yǎng)細(xì)胞,為后期基因組DNA 進(jìn)行PCR 分析做準(zhǔn)備。GENO 對(duì)微孔板中大量培養(yǎng)細(xì)胞,進(jìn)行高通量均質(zhì)化處理,再通過(guò)層析樹脂對(duì)核酸進(jìn)行純化,從而進(jìn)行PCR 分析,大大提高基因組分析的效率。
Yeast 酵母的9 6 孔高通量破碎
酵母已成為基因表達(dá)研究和蛋白質(zhì)重組表達(dá)的通用宿主,成為生物系統(tǒng)研究模式型生物,成為生物藥學(xué)家的有力工具。包括Picbia、Hansenula、Debaryomyces 均被研究者所使用,如Saccbatomyces 酵母。酵母mRNA 和細(xì)胞內(nèi)蛋白,很難用傳統(tǒng)酶解方法提取。裂解酶中通常含有核糖核酸酶和其他蛋白,它們不僅會(huì)攻擊細(xì)胞壁,而且會(huì)攻擊特定分子。并且,酶解產(chǎn)生的原生質(zhì)體,需借助特定的試劑進(jìn)行溶解,而導(dǎo)致很多蛋白質(zhì)變性失活。
通常的壓榨或球磨方式,只能在單樣品下破碎酵母細(xì)胞,釋放其內(nèi)溶物,操作效率太低。GENO 專為那些需要大量酵母克隆進(jìn)行高通量篩選檢測(cè)的實(shí)驗(yàn),設(shè)計(jì)了破碎種子的深孔板,在深孔板中對(duì)酵母進(jìn)行破碎。實(shí)現(xiàn)高通量地分裂細(xì)胞。
細(xì)菌細(xì)胞的裂解(嗜鹽菌和桿菌)Bacterial Cells
GENO 借助碰撞,裂解細(xì)菌細(xì)胞。以格蘭氏陰性耐鹽菌Halomonas elongate 和格蘭氏陽(yáng)性桿菌為模式的研究對(duì)象,SPEX 發(fā)展了兩種相應(yīng)技術(shù):1)細(xì)菌培養(yǎng),收獲并沖洗掉多余的培養(yǎng)基,將細(xì)胞懸浮于深孔板的鹽水溶液中,2)GENO 可借助研磨介質(zhì), 進(jìn)行細(xì)胞振蕩破碎,6-9 分鐘就釋放出足夠量的核酸,進(jìn)行后續(xù)試驗(yàn)。
QuEChERS 方法
Geno/Grinder 研磨儀可用于QuEChERS 方法中的樣品處理步驟,可以用Geno研磨儀進(jìn)行水果、蔬菜植物組織的均質(zhì)化,從而更高效、快速的研磨處理樣品,為后續(xù)的LC/MS/MS 方法測(cè)試殘留農(nóng)藥做準(zhǔn)備。可以在室溫下均質(zhì)化或者配合Kryo-Tech 冷凍裝置使用,為了消除交叉污染需要添加QuEChERS 試劑。
目前,美國(guó)FDA 食品藥品管理局和美國(guó)環(huán)保局EPA均采用Geno 研磨儀作為標(biāo)準(zhǔn)設(shè)備進(jìn)行水果、蔬菜植物組織的均質(zhì)化處理。
根據(jù)美國(guó)環(huán)保署U S E P A 和食品藥物管理局U S F D A, L C / M S / MS 測(cè)試食品殘留農(nóng)藥,樣品處理采用不同方法之比較說(shuō)明
采用GENO/Grinder 萃取器來(lái)增快殘留農(nóng)藥, 霜脲氰(Cymoxanil),的LC/MS/MS 分析之樣品處理,其產(chǎn)能達(dá)到一般方法三倍、杜邦方法兩倍數(shù)量的樣品,大大節(jié)省時(shí)間人力成本的耗費(fèi)。回收率(SPIKERECOVERY) 和其他QA/QC 的效果一致。